Chùa Khánh Sơn nằm khuất dưới vòm cây có hoa phượng đỏ. Chùa tọa lạc ở độ cao 20 mét, dựa lưng vào phía nam núi Chóp Chài. Ngay trước cửa tam quan là tượng Phật Bà Quan Âm cao 2 mét đứng giữa đài sen kiên cố và lộng lẫy. Leo lên khoảng 107 bậc đá, bạn sẽ nhìn thấy cổng chùa bằng gạch cũ đổ nát như thách thức với sương gió và thời gian.
Khi đến Phú Yên, bạn nên ghé thăm chùa Khánh Sơn để một lần cảm nhận dáng vẻ thâm u, tĩnh lặng của ngôi chùa này.