Chùa Từ Vân là ngôi chùa độc nhất vô nhị ở Việt Nam, bởi toàn bộ ngôi chùa được xây dựng chủ yếu từ vỏ ốc và san hô.

Ấn tượng nhất với du khách là tháp Bảo Tích cao 39 m được ghi nhận là cao nhất Việt Nam. Tháp có cấu trúc cầu kỳ với 49 tiểu tháp hình chóp ở bên ngoài, trong mỗi tiểu tháp có một tượng Phật nghìn tay, nghìn mắt; trên đỉnh mỗi tiểu tháp lại có một bảo tháp nhỏ. Cứ thế hàng trăm pho tượng Phật lớn nhỏ được sắp xếp tỉ mỉ trên tòa tháp này. Tháp được thiết kế và xây dựng bằng phương pháp thủ công bởi chính bàn tay tài hoa, óc sáng tạo của các sư thầy tu hành trong chùa với chất liệu chính từ đá san hô và được trang trí hoa văn từ những vỏ sò, vỏ ốc.

Ngoài ra, du khách không nên bỏ lỡ khám phá 18 tầng địa ngục, rất bí ẩn và kỳ thú. Hãy mang theo nến, đèn pin, hoặc dùng đèn từ điện thoại khi vào “địa ngục”, vì đường rất tối và nhỏ. Dọc lối đi là 12 tấm bảng ghi lại tội ác của trần gian và hình phạt nơi cửa ngục, giống như lời khuyên răn con người sống hướng thiện, nhân từ. Sẽ đôi lúc bạn bị giật mình vì cảnh "tra tấn rùng rợn" thoáng ẩn hiện ra trong ánh sáng lập lòe. Vượt hết “18 tầng địa ngục” và đi qua chiếc cầu Nại Hà, theo thuyết nhà Phật là bạn đã kết thúc mọi đau khổ và trở lại trần gian, bằng cửa ra là miệng của một con rồng lớn.